Югорский государственный университет основан по инициативе Правительства Ханты-Мансийского автономного округа - Югры. Вуз создан распоряжением Правительства Российской Федерации от 20.08.2001 г. №1069-р и приказом Министерства образования РФ от 5.10.2001 г. № 3296 на базе Ханты-Мансийских филиалов.
15 ноября 2002 года Югорский государственный университет был внесен в Единый государственный реестр юридических лиц как государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Югорский государственный университет».
Распоряжением Правительства Российской Федерации от 7 сентября 2007 г. № 1186-р университет был реорганизован в форме присоединения к нему в качестве обособленных структурных подразделений (филиалов) государственного образовательного учреждения среднего профессионального образования «Нижневартовский нефтяной техникум», государственного образовательного учреждения среднего профессионального образования Сургутского нефтяного техникума, государственного образовательного учреждения среднего профессионального образования Лянторского нефтяного техникума и государственного образовательного учреждения среднего профессионального образования Нефтеюганского индустриального колледжа.
Приказом Министерства образования и науки Российской Федерации от 23 мая 2011 г. № 1717 государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Югорский государственный университет» переименовано в федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Югорский государственный университет», которое приказом Министерства образования и науки Российской Федерации от «29» октября 2015 г. №1234 переименовано в федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Югорский государственный университет»
В настоящее время Югорский государственный университет является одним из самых молодых государственных вузов России.
Особая заслуга по созданию университета принадлежит Александру Филипенко (Губернатор Ханты-Мансийского автономного округа - Югры 1995-2010 гг.). Под его руководством была проведена планомерная, долгая и кропотливая работа, в результате которой 20 августа 2001 года премьер-министром Российской Федерации было подписано распоряжение о создании в Ханты-Мансийске государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования "Югорский государственный университет".
Мы доказали, что округ может являться местом для проживания, а не только территорией для временного пребывания рабочей силы,- сказал Александр Филипенко, - население округа нуждается в образовательных услугах, и эффективнее подготовка специалистов будет проходить на месте, что в свою очередь предупредит опасность миграции талантливой молодежи".
